万博体育水位高:《核酸研究》同期发表生命学院“健康大数据”团队5篇论文

  • 文章
  • 时间:2018-10-09 09:52
  • 人已阅读

  新闻网讯 1月4日,核酸及生物信息学等畛域顶级期刊《核酸研讨》(Nucleic Acids Research,影响因子:10.162)的“annual Database Issue”同期刊发性命学院“安康大数据”团队的5篇论文,此中3篇论文万博体育水位高为第一作者单位、团队成员为通信作者,标题别离为“lncRNASNP2: an updated database of functional SNPs and mutations in human and mouse lncRNAs”、“iUUCD 2.0: an update with rich annotations for ubiquitin and ubiquitin-like conjugations”和“MVP: a microbe–phage interaction database”,同时还介入发表了“Database Resources of the BIG Data Center in 2018”和“dbCoRC: a database of core transcriptional regulatory circuitries modeled by H3K27ac ChIP-seq signals”两篇论文。   近年来,随着“精准医学”企图的公布,如何无效整合海量的高异质性、高复杂性生物医学大数据成为性命科学和医学畛域的严重命题和应战。围绕哺乳动物长非编码RNA(lncRNA)与遗传变异的关连,郭安源教学研讨组在已有研讨基础上开发了lncRNASNP2数据库,包孕25万多条人类和小鼠lncRNA的约1100万个单核苷酸多态性数据,并整合了功能正文、癌症渐变、转录表白、疾病相干信息、布局变异,以及miRNA-lncRNA相互作用等信息,该事情为研讨lncRNA的功能和异构体供应了首要数据资源;针对真核生物泛素及类泛素偶联润色,薛宇教学课题组零碎收录了148种真核生物中13万多个相干调控因子,构建iUUCD 2.0数据库并整合序列、癌症渐变、单核苷酸多态性、调控元件、蛋白质相互作用、三级布局、疾病相干信息、药物和靶标、蛋白质翻译后润色、DNA甲基化、蛋白质表白和蛋白质组信息,该事情对进一步研讨泛素及类泛素偶联的机制存在首要意义;与德国有名生物信息学家Peer Bork教学合作,刘智教学和陈卫华教学两个课题组零碎审编和收集了18,608种噬菌体群与9245种微生物之间的26,572个两两相互作用关连,构建了微生物-噬菌体整合数据库MVP,该数据资源对将来环境微生物组学研讨存在首要的撑持作用。   “安康大数据”团队由郭安源、宁康、薛宇和陈卫华四位教学组成,2016年被选华中科技万博体育水位高“学术前沿青年团队”,2017年在万博体育水位高鄂州工业技术研讨院筹建“生物医学信息超算核心”。